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摘 要： 摘要生物體在正常生命過程中面臨內(nèi)/外因來源的DNA損傷，DNA損傷不僅影響基因正確復(fù)制，也阻礙其正常轉(zhuǎn)錄.為避免DNA損傷帶來的災(zāi)難性后果，生物體進(jìn)化出一整套修復(fù)機(jī)制，以保證復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的正確性、基因組的完整性和遺傳的穩(wěn)定性.本文重點(diǎn)綜述了RNA聚合酶監(jiān)視
摘要生物體在正常生命過程中面臨內(nèi)/外因來源的DNA損傷，DNA損傷不僅影響基因正確復(fù)制，也阻礙其正常轉(zhuǎn)錄.為避免DNA損傷帶來的災(zāi)難性后果，生物體進(jìn)化出一整套修復(fù)機(jī)制，以保證復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的正確性、基因組的完整性和遺傳的穩(wěn)定性.本文重點(diǎn)綜述了RNA聚合酶監(jiān)視(RNApolymerase-surveilled,RNAP-S)的DNA修復(fù)機(jī)制.首先從RNAP結(jié)構(gòu)出發(fā)介紹了RNAP對DNA損傷的感知機(jī)制;其次討論了滯留RNAP的回溯、與其模板DNA的解離以及后續(xù)修復(fù)機(jī)制的啟動，真核細(xì)胞CSB及其泛素化和OGG1介導(dǎo)的RNAP-S修復(fù);最后探討了RNAP-S損傷修復(fù)的生物學(xué)意義并對其前景進(jìn)行了展望.
關(guān)鍵詞RNA聚合酶，DNA損傷，RNAP感知損傷，RNAP-S修復(fù)機(jī)制1
0引言
DNA是生物體遺傳物質(zhì)，其完整性對生命活動的正常運(yùn)行有著關(guān)鍵的作用[1].然而，生物體基本無法避免來自外界和生物體自身內(nèi)部的DNA損傷，若不及時(shí)修復(fù)這些損傷，將會對生物體產(chǎn)生災(zāi)難性的后果[2]：(1)DNA復(fù)制(replication)和轉(zhuǎn)錄(transcription)過程將不能正常進(jìn)行，嚴(yán)重影響了基因組的完整性和穩(wěn)定性[3];(2)會導(dǎo)致細(xì)胞的功能阻礙[1]，細(xì)胞癌變[4-6]，死亡[7];(3)也會引發(fā)生物體的各種疾病[4].
染色體復(fù)制過程中的堿基錯(cuò)配、水解和脫氨基作用是自發(fā)性損傷的主要來源[2].DNA損傷的外因來源較多，誘變劑能夠引發(fā)烷化、氧化等作用造成突變[8];紫外線誘變形成嘧啶二聚體從而不能配對[9];γ射線、X射線會引起DNA雙鏈的斷裂[8];嵌入劑能引起堿基的插入或缺失[8].面對無法避免的DNA損傷，生物體進(jìn)化出相應(yīng)的DNA損傷修復(fù)系統(tǒng)來應(yīng)對這些挑戰(zhàn).常見的DNA損傷修復(fù)方式有：光激活修復(fù)、錯(cuò)配修復(fù)、剪切修復(fù)，重組修復(fù)、跨損修復(fù)和非同源末端修復(fù)等[2,9](.1)光激活修復(fù)系統(tǒng)(photoreactivationrepair,PHR)修復(fù)紫外線誘變形成的嘧啶二聚體，被光激活的DNA光解酶斷裂嘧啶二聚體之間的共價(jià)鍵而實(shí)現(xiàn)直接修復(fù)此類DNA損傷[8];(2)錯(cuò)配修復(fù)(mismatchrepair,MMR)用來修復(fù)DNA復(fù)制過程中的堿基錯(cuò)配[10].原核細(xì)胞MutS、MutL和MutH蛋白通過新復(fù)制DNA半甲基化特性識別錯(cuò)配位點(diǎn)并在其附近切開新鏈、后由UvrD解旋消化產(chǎn)生缺口，再以正確(舊鏈)鏈為模板，由DNA聚合酶和DNA連接酶生成新正確鏈，完成錯(cuò)配修復(fù)[2,10].真核細(xì)胞同源蛋白MSH、MLH、PMS通過類似方式完成錯(cuò)配修復(fù)[10];(3)剪切修復(fù)(excisionrepair,ER)包括核苷酸切除(nucleotideexcisionrepair,NER)和堿基切除修復(fù)(baseexcisionrepair,BER)兩種.大腸桿菌UvrA、UvrB、UvrC和UvrD能夠識別雙螺旋上的扭曲，并切除含有損傷的一小段單鏈片段，后由DNA聚合酶和連接酶修補(bǔ)至正確序列而實(shí)施核苷酸切除修復(fù)[11].人細(xì)胞XPC、XPA、XPD、RPA、XPG和XPF等同源蛋白執(zhí)行相同的功能[9].在堿基切除修復(fù)中，NTHL1、NEIL1或OGG1糖基化酶先切除錯(cuò)誤堿基，隨后無堿基(apurinic-apyrimidinic,AP)位點(diǎn)內(nèi)切酶或外切核酸酶切除形成的無堿基戊糖，所形成的缺口由DNA聚合酶和連接酶修復(fù)[2].(4)同源重組修復(fù)(homologousrecombination,HR)過程可修復(fù)雙鏈斷裂(double-strandbreak,DSB)損傷，也修復(fù)DNA復(fù)制中的錯(cuò)誤[12].原核細(xì)胞DSB修復(fù)途徑被稱為RecBCD途徑，參與的重要蛋白有RecA、RecBCD、RecFOR、RuvAB和RuvC[12].真核細(xì)胞Rad51、Dcm1、Spo11、MRX、Rad52、Rad59、Rad51c-XRCC3、WRN和BLM完成同源重組修復(fù)[9];(5)非同源末端修復(fù)(nonhomologousendjoining,NHEJ)是姐妹染色單體形成前的一種修復(fù)方式[9].在哺乳動物中，已發(fā)現(xiàn)該途徑的相關(guān)蛋白有Ku70、Ku80、DNA-PKcs、Artemis和XRCC4等[3,9](.6)跨損DNA合成(translesionsynthesis,TLS)指細(xì)胞未能修復(fù)損傷時(shí)，復(fù)制機(jī)器繞過受損部位而無模板直接合成DNA鏈的修復(fù)機(jī)制，可避免染色體的不完全復(fù)制[13].原核細(xì)胞DNAPolIV(DinB)或DNAPolV[8]，真核細(xì)胞REV1、Polδ、Polε、Polκ和Polτ負(fù)責(zé)跨損合成[2].
基因轉(zhuǎn)錄過程本身也是獨(dú)特的DNA損傷修復(fù)機(jī)制[14].本文重點(diǎn)綜述了轉(zhuǎn)錄過程中RNA聚合酶(RNApolymerase,RNAP)監(jiān)視下的修復(fù)機(jī)制，該機(jī)制對DNA損傷的修復(fù)有重要的作用，也有利于解決復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的沖突，確保正確轉(zhuǎn)錄物的形成，對生物體的正常活動有著不容忽視的作用[3,14-16].
1RNAP識別DNA損傷并滯留
當(dāng)轉(zhuǎn)錄中的DNA雙鏈產(chǎn)生誘變損傷時(shí)，轉(zhuǎn)錄模板鏈(templatestrand)的修復(fù)程度要高于編碼鏈(codingstrand)[17,18]，模板鏈的修復(fù)比編碼鏈的修復(fù)更快，而編碼鏈的修復(fù)與基因組DNA的修復(fù)節(jié)奏基本一致，可見轉(zhuǎn)錄中優(yōu)先修復(fù)模板鏈的DNA損傷[19-21].RNAP沿模板DNA轉(zhuǎn)錄過程中，會感知DNA損傷，并招募修復(fù)蛋白，繼而修復(fù)損傷DNA[22]，在此我們稱之為RNAP監(jiān)視(RNAP-surveilled,RNAP-S)的DNA修復(fù)(RNAP-Srepair).RNAP監(jiān)視的DNA修復(fù)不僅存在于活躍轉(zhuǎn)錄過程，也可見于低水平轉(zhuǎn)錄過程[20]，而且在進(jìn)化上是保守的細(xì)胞過程[1].
1.1RNAP被DNA損傷物理阻止
轉(zhuǎn)錄模板鏈上的DNA損傷，如單鏈斷裂[23]、雙鏈斷裂[24]等會阻礙RNAP在模板鏈上的正常前行.此外，非正規(guī)的DNA結(jié)構(gòu)如DNA發(fā)夾、RNA:DNA雜合體[25]、莖環(huán)結(jié)構(gòu)[26]也會物理障礙性造成RNAP的滯留;同樣，DNA結(jié)合蛋白如抑制子[27]、轉(zhuǎn)錄終止因子Rho蛋白結(jié)合在模板DNA上會阻滯RNAP;真核細(xì)胞核小體結(jié)構(gòu)也會阻礙轉(zhuǎn)錄中RNAP的前行[27].的確，數(shù)學(xué)模型和定量實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，減少LacI路障的占用能明顯增加RNAP的變位(dislodgement)[27];聚丙酰胺凝膠電泳(polyacrylamidegelelectrophoresis,PAGE)實(shí)驗(yàn)結(jié)果說明RNAP也能被1,N6乙烯基腺嘌呤修飾(1,N6-ethenoadenine,εA)強(qiáng)烈阻礙[28];利用掃描力顯微鏡(scanningforcemicroscopy,SFM)和磁鑷(magnetictweezers,MT)監(jiān)測RNAP在含有拓?fù)洵h(huán)結(jié)構(gòu)的DNA鏈上的行進(jìn)過程，發(fā)現(xiàn)DNA環(huán)形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)能有效的阻礙RNAP而干擾轉(zhuǎn)錄[29].
1.2RNAP識別DNA損傷修飾
1.2.1三種RNAP的結(jié)構(gòu)功能
多亞基蛋白復(fù)合體RNAP保守存在于細(xì)菌、古細(xì)菌、真核生物中，轉(zhuǎn)錄合成各類RNA，其核心酶(coreenzyme)發(fā)揮主要合成作用.最簡單的細(xì)菌RNAP核心酶由β、β’、ɑ二聚體、ω亞基構(gòu)成[30].古細(xì)菌核心酶與真核生物RNAPⅡ有顯著的結(jié)構(gòu)保守性[31].真核生物的三種RNAP核心酶結(jié)構(gòu)具有同源性，其中有兩個(gè)亞基較為保守，160kDa左右的Rpa1、Rpb1、Rpc1，大約150kDa的Rpa2、Rpb2、Rpc2分別是RNAPⅠ、RNAPⅡ、RNAPⅢ的2個(gè)亞基[30].此外，三種RNAP還都具有Rpb5、Rpb6、Rpb8、Rpb10、Rpb12亞基[32].但它們功能存在差別：RNAPⅠ負(fù)責(zé)合成核糖體RNA(ribosomalRNA,rRNA)[30];RNAPⅡ與信使RNA(messengerRNA,mRNA)、多數(shù)小核內(nèi)RNA(smallnuclearRNA，snRNA)、微小RNA(microRNAs)的合成有關(guān)[30];轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(transferRNA,tRNA)、5SrRNA和一些其它小RNA(smallRNA)由RNAPⅢ合成[30,33](表1).
1.2.2RNAPII結(jié)構(gòu)
真核生物的多亞基蛋白RNAPⅡ負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄所有編碼蛋白的基因和許多非編碼RNA，也在RNAP-S修復(fù)中感知損傷[35].RNAPⅡ幾個(gè)重要的結(jié)構(gòu)域：(1)RNAPⅡ的突出結(jié)構(gòu)特征—裂口(cleft)，是一個(gè)深的、帶有正電的凹槽，包含活性位點(diǎn)(activesite)、壁(wall)、突出物壁(protrusion)等[36].DNA雙鏈在解鏈前位于裂口的上方，當(dāng)DNA雙鏈解鏈后模板鏈進(jìn)入裂口到達(dá)活性位點(diǎn)，核糖核苷酸(ribonucleotidetriphosphates,NTPs)從漏斗(funnel)位點(diǎn)處進(jìn)入;形成的RNA:DNA雜合鏈在靠近活性位點(diǎn)的壁處分離，起始于壁附近的RNA出口通道引導(dǎo)RNA離開;位于裂口DNA出口處的突出物—壁，可能負(fù)責(zé)模板DNA鏈從RNAPⅡ離開的過程[36].(2)RNAPⅡ的觸發(fā)環(huán)(triggerloop,TL)和橋螺旋(bridgehelix,BH)是兩個(gè)重要的與DNA堿基識別、保真性相關(guān)的結(jié)構(gòu)域[36,37].Rpb1亞基上的TL負(fù)責(zé)磷酸二酯鍵的形成，影響轉(zhuǎn)錄中NTPs的添加效率[37]，并保持底物特異性[35];在活性位點(diǎn)處添加NTPs時(shí)，其構(gòu)象從開放轉(zhuǎn)變?yōu)殛P(guān)閉從而激活活性[37];BH負(fù)責(zé)連接RNAPⅡ的兩個(gè)部分，將RNAPⅡ催化位點(diǎn)與下游的主、次要通道分開，模板裝載中越過BH的步驟可作為RNAP變位的檢驗(yàn)點(diǎn)[37].(3)其它結(jié)構(gòu)域例如：夾鉗(clamp)、莖稈(stalk)同樣是RNAPⅡ的重要結(jié)構(gòu)，負(fù)責(zé)調(diào)控裂口的開放、閉合構(gòu)象[36];舵(rudder)和蓋(lid)是Rpb1結(jié)構(gòu)域的殘基，靠近活性位點(diǎn)，有利于將RNA引導(dǎo)至其出口通道，將DNA引導(dǎo)到壁突起處[36];Rpb1的C-末端結(jié)構(gòu)域(C-terminaldomain,CTD)是調(diào)控RNAPⅡ轉(zhuǎn)錄的中心[38].
1.2.3RNAPII識別DNA損傷修飾并滯留
RNAPⅡ能識別UV誘導(dǎo)下產(chǎn)生的鏈內(nèi)交聯(lián)損傷[39]、具有輕度螺旋扭曲特性的環(huán)丁烷丙胺二丁二聚酯(cyclobutenepyrimidinedimers,CPD)、具有強(qiáng)螺旋扭曲特性的6-4光產(chǎn)物(pyrimidine-pyrimidonephotoproduct,6-4PP)[40,41]、脫氧尿苷、8-氧腺嘌呤(8-oxyadenine,8oA)、8-氧鳥嘌呤(8-oxoguanine,8oG)[23]、胸苷二醇(thymidineglycol,TG)[31]、烷基化損傷[42,43]、無堿基損傷[44]、煙草相關(guān)誘變劑產(chǎn)生的鳥嘌呤加合物[4]的損傷、雙鏈斷裂[5,24,25,45]以及DNA發(fā)夾、RNA:DNA雜合體等非正規(guī)的DNA結(jié)構(gòu)[25].
RNAPⅡ在感知DNA損傷時(shí)，不與受損的堿基直接發(fā)生作用，而是感知其轉(zhuǎn)錄發(fā)生障礙后引起的空間位阻(sterichindrance)[46].裝載DNA模板時(shí)，DNA下游模板需要越過橋螺旋(BH)，才能到達(dá)活性位點(diǎn)添加NTPs以進(jìn)行正常轉(zhuǎn)錄，此跨越步驟(crossing-overstep)需要模板發(fā)生顯著的構(gòu)象變化[37,46].但存在大規(guī)模DNA損傷的DNA鏈往往由于受損的堿基與RNAPⅡ的橋螺旋結(jié)構(gòu)上方相結(jié)合而不能發(fā)生正常的構(gòu)象變化[35,37,47]，RNAPⅡ無法正常裝載DNA模板鏈，變位步驟受到阻礙因此發(fā)生滯留現(xiàn)象[46].CPD，AP部位和5-胍海因(5-guanidinohydantoin,Gh)這幾種損傷引起的DNA損傷構(gòu)象也都能較為穩(wěn)定的結(jié)合于橋螺旋的上方部位，這是RNAPⅡ的Rpb1亞基中的Arg337與損傷的DNA鏈磷酸基團(tuán)相互作用的結(jié)果，而在正常轉(zhuǎn)錄過程中，該狀態(tài)是短暫存在的[46].DNA堿基胞嘧啶甲基化修飾的中間物5-羧基胞嘧啶(5-carboxylcytosine,5caC)也與RNAPⅡ的橋螺旋結(jié)構(gòu)上方結(jié)合，Rpb2亞基通過Q513殘基，特異性識別5caC，并最終誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄的停止[35,37](圖1).
當(dāng)遇到較小的損傷如CPD、AP、Gh時(shí)，RNAPⅡ雖然受到阻礙，但不足以被滯留[37,46,47].在這種狀態(tài)下，RNAPⅡ緩慢的經(jīng)過損傷位點(diǎn)，并發(fā)生不依賴于模板的AMP優(yōu)先的堿基錯(cuò)誤摻入，導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA中相對損傷的位點(diǎn)的突變，這種易錯(cuò)的修復(fù)方式(error-pronetranscriptionalbypass)被稱作A規(guī)則(A-rule)[37](圖1).形成的含有錯(cuò)誤堿基的RNA:DNA雜合鏈在穿過雜合鏈通道(hybridbindingchannel)時(shí)也會受到嚴(yán)重的阻礙，不過在8oA損傷研究中發(fā)現(xiàn)這種延伸受阻現(xiàn)象僅出現(xiàn)于損傷后的3nt內(nèi)，當(dāng)移動足夠遠(yuǎn)時(shí)，雜合鏈的任何變形都可以被容忍，以便RNAPⅡ發(fā)揮更快的催化作用[31].這種以摻入錯(cuò)誤堿基選擇繞過損傷的方式也與觸發(fā)環(huán)結(jié)構(gòu)域閉合狀態(tài)相關(guān)[46].在原核生物中，也存在易錯(cuò)修復(fù)方式[48,49].此外，不同生物的RNAP應(yīng)對不同的損傷[31].與噬菌體、細(xì)菌、真核生物的RNAP相比，古細(xì)菌的RNAP具有更高的敏感度，能識別并滯留在多種損傷處[31](表2).
2RNAP監(jiān)視的DNA損傷修復(fù)機(jī)制
在RNAP監(jiān)視的DNA損傷修復(fù)過程中，滯留的RNAP信號會被轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)因子識別，RNAP可以從模板鏈解離(dissociated)[50]、回溯變位(backtracked)[51]、降解(degraded)[52]，并引發(fā)后續(xù)修復(fù)蛋白的組裝和修復(fù).
2.1滯留RNAP解離和修復(fù)啟動
細(xì)菌中mfd基因的缺失會導(dǎo)致基因突變率下降[53,54]，其編碼的轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)修復(fù)因子Mfd(mutationfrequencydecline)介導(dǎo)RNAP-S-NER過程[55].Mfd識別并結(jié)合轉(zhuǎn)錄模板鏈上滯留的RNAP，利用其轉(zhuǎn)位酶活性，使RNAP從DNA模板鏈上解離下來，并招募NER修復(fù)因子、DNAPolI、DNA連接酶完成DNA的損傷修復(fù)[56](圖2).Mfd具有D1、D2、D3、D4、D5、D6、D7等多個(gè)結(jié)構(gòu)域.N-末端的D1a、D2、D1b組成UvrB的同源組件(UvrBhomologymodule,BHM)，可與UvrA相互作用;D4能與RNAP的β亞基相互作用;D5、D6是馬達(dá)結(jié)構(gòu)域，驅(qū)動Mfd在DNA上的變位[55];D7與N-末端相互作用，使蛋白處于無活性構(gòu)象，只有與RNAP相互作用，Mfd才能穩(wěn)定結(jié)合于DNA鏈，發(fā)揮移位酶的活性[56,57].
“Mfd釋放追趕”模型(releaseandcatch-upmodel)說Mfd可以獨(dú)自在裸露的DNA鏈上移位以搜索滯留的轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合物[58]，的確有體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證明Mfd可單獨(dú)結(jié)合于雙鏈DNA[57].Mfd在DNA鏈上通過轉(zhuǎn)位酶結(jié)構(gòu)域的TD1、TD2交替步向前移位，但運(yùn)動速度慢、持續(xù)時(shí)間短，如果遇到滯留的RNAP，Mfd會與RNAP發(fā)生相互作用，并更穩(wěn)定的與DNA結(jié)合[58].單分子實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了Mfd與RNAP的結(jié)合，并說明細(xì)胞中通常處于“關(guān)閉狀態(tài)”—無活性構(gòu)象的Mfd，遇到滯留在模板鏈上的RNAP便通過其D4結(jié)構(gòu)域與RNAP的β亞基相互作用，引起D2-D7抑制型構(gòu)象發(fā)生變化，并激活其轉(zhuǎn)位酶活性[57].借助ATP水解提供的能量，Mfd取代RNAP使其從DNA模板解離，從而暴露出模板鏈上的損傷部位[55]，同時(shí)Mfd也露出BHM結(jié)構(gòu)域，并招募結(jié)合UvrA[11].細(xì)胞內(nèi)單分子研究驗(yàn)證UvrA遠(yuǎn)端的ATP酶位點(diǎn)催化ATP水解，使UvrA二聚體與Mfd結(jié)合，并導(dǎo)致移位停止，同時(shí)招募UvrB，形成Mfd-2UvrA-UvrB復(fù)合物，隨后UvrA近端ATP酶催化ATP水解，使UvrB通過β發(fā)夾與DNA結(jié)合，并最終導(dǎo)致2UvrA與Mfd同時(shí)解離[11,56].后續(xù)招募的UvrD和UvrC分別發(fā)揮移除損傷單核苷酸鏈和切除DNA的作用，其形成的缺口由DNA聚合酶和DNA連接酶修復(fù)完全[55].值得一提的是，Mfd可以解離模板鏈上較強(qiáng)損傷處的RNAP，也能促進(jìn)較弱損傷處RNAP的變位而跨越損傷[58].事實(shí)上，Mfd可與非NER因子共同作用，以一種易錯(cuò)的方式修復(fù)DNA損傷[48,49].當(dāng)DNA復(fù)制叉與轉(zhuǎn)錄中的RNAP發(fā)生碰撞時(shí)，Mfd可通過促進(jìn)RNAP的變位，促使碰撞后的復(fù)制叉直接重啟[16]，但在低核苷酸濃度下，RNAP大多選擇滯留，此時(shí)Mfd會增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄終止[58].
DksA，以Mfd類似方式，也會解離滯留在DNA損傷處的RNAP，進(jìn)而修復(fù)DNA模板上的損傷[59].DksA由151氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄因子,具有5條α螺旋，分成3個(gè)結(jié)構(gòu)域[60].分別是球形結(jié)構(gòu)域(Gdomain)、卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域(CCdomain)、C-末端結(jié)構(gòu)域(C-terminaldomain)[61].DksA通過CC結(jié)構(gòu)域進(jìn)入RNAP的次級通道與RNAP相互作用，但并不與活躍的轉(zhuǎn)錄復(fù)合物結(jié)合[62].DksA單獨(dú)與RNAP的相互作用使得RNAP的DNA結(jié)合主通道βlobe/i4結(jié)構(gòu)域發(fā)生變化，從而破壞RNAP的穩(wěn)定性[59].不過，體外研究表明DksA并不影響RNAP穩(wěn)定性[59].DksA單獨(dú)與RNAP的結(jié)合會降低RNAP-DNA穩(wěn)定性，有助于移除RNAP而暴露損傷的DNA片段，但此過程并不破壞RNA:DNA雜合體，RNA還可為DNA合成作引物[59,63].
不同誘導(dǎo)劑引發(fā)的DNA雙鏈斷裂損傷中，DksA的應(yīng)答存在差異[59,62].對腐草霉素(Phleomycin)誘導(dǎo)所產(chǎn)生DNA的DSB損傷，DksA以一種被動作用的方式參與RNAP-S修復(fù)[62].DksA和GreA同為RNAP次級通道的結(jié)合因子.與ppGpp協(xié)同[19]，DksA可通過與反回溯因子GreA競爭性結(jié)合RNAP次級通道而增強(qiáng)UvrD的回溯作用[62].對萘啶酸(nalidixicacid,Nal)誘導(dǎo)產(chǎn)生的帶有拓?fù)洚悩?gòu)酶復(fù)合物的DSB損傷來說DksA是必須的[59].此時(shí)DksA不依賴于ppGpp，而是直接促進(jìn)RNAP的移除但并不發(fā)生RNA的解離[59].——論文作者：王菲爾**，楊繹煊**，莫日根**
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