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IBD法在堂表親緣關系鑒定中的應用

發布時間:所屬分類:法律論文瀏覽:1

摘 要: 【摘要】目的使用血緣一致性(identitybydescent,IBD)法計算堂表親緣關系的堂表關系指數(firstcousinindex,FCI)和累積堂表關系指數(combinedfirstcousinindex,CFCI),為IBD法鑒定兩個個體是否具有堂表親緣關系提供科學手段。方法取124對堂表兄弟姐妹和186

  【摘要】目的使用血緣一致性(identitybydescent,IBD)法計算堂表親緣關系的堂表關系指數(firstcousinindex,FCI)和累積堂表關系指數(combinedfirstcousinindex,CFCI),為IBD法鑒定兩個個體是否具有堂表親緣關系提供科學手段。方法取124對堂表兄弟姐妹和186對無親緣關系個體的口腔拭子,檢驗每人18個常染色體STR基因座的等位基因,用IBD法計算堂表對和無關個體對的FCI和CFCI,并用判別分析的方法對兩組樣本的FCI和CFCI計算結果進行分析。結果CFCI在堂表對和無關個體對中的頻率分布呈偏正態分布,前者的平均值和標準差為11.864和21.678,后者為0.605和0.988,兩者具有顯著差異。以CFCI/(CFCI+1)≥0.6為標準,堂表對和無關個體對判別準確率為88.387%;依據各常STR基因座的FCI計算結果建立判別方程,多元判別方程和多元逐步判別方程的判別準確率分別為92.258%和91.935%。結論用IBD法和依據IBD建立的判別分析法可以用于堂表親緣關系的篩選。

IBD法在堂表親緣關系鑒定中的應用

  【關鍵詞】法醫遺傳學;IBD法;堂表親緣關系;判別分析

  堂表親緣關系是指同父同母的兄弟姐妹的子女之間的親緣關系,屬于復雜親緣關系的一種。復雜親緣關系鑒定是指由于父或(和)母已亡,或因為其他原因不能參與檢驗(父母均不參與鑒定),為了民事或刑事案件中的個體識別等而進行的特殊親緣關系鑒定[1]。這種親緣關系鑒定案件由于重要被鑒定人的缺失,需要隔代、同胞或旁系親屬參加檢驗。鑒定堂表親緣關系,主要有血緣一致性(identitybydescent,IBD)法和狀態一致性(identity-by-state,IBS)法兩種計算方法,本研究使用IBD法計算堂表親緣關系的堂表關系指數(firstcousinindex,FCI)和累積堂表關系指數(combinedfirstcousinindex,CFCI),并用統計學方法建立相應數學模型,探索如何鑒定兩個體是否具有堂表親緣關系。

  1材料和方法

  1.1樣本來源

  選擇124對確定具有堂表兄弟姐妹關系的個體,采集其口腔拭子樣本;從無血緣關系的人群中隨機選擇186對個體,采集其口腔拭子樣本備檢。

  1.2樣本的DNA提取、擴增及STR分型

  使用磁珠法提取口腔拭子樣本中的DNA,采用AGCUExpressmarter25(EX25)熒光試劑盒(無錫中德美聯生物技術有限公司)擴增D3S1358,D13S317,D7S820,D16S539,D1S1656,PentaE,TPOX,TH01,D2S1338,CSF1PO,PentaD,D19S433,vWA,D21S11,D18S51,D6S1043,D8S1179,D5S818,D12S391,FGA,D22S1045,D2S441,D10S1248共23個常染色體STR基因座,擴增產物經ABI3130遺傳分析儀(美國應用生物系統公司)電泳檢測,用GeneMapperID軟件(美國應用生物系統公司)分析各基因座的基因型。

  1.3IBD法計算FCI和CFCI

  從23個常染色體STR基因座中選擇最常用的18個常染色體STR基因座(D3S1358,D13S317,D7S820,D16S539,PentaE,TPOX,TH01,D2S1338,CSF1PO,D19S433,vWA,D21S11,D18S51,D6S1043,D8S1179,D5S818,D12S391,FGA),根據各基因座等位基因頻率資料,陸惠玲等提供的計算方法[2],分別計算124對堂表兄弟姐妹和186對無親緣關系個體的FCI和CFCI。計算方法如下:設血緣機會大小為R1,隨機兩個體血緣關系大小為R0,則R1=COO+CTT+CII(1),式中CI、CT、CO是指兩個體間有2個、1個或者沒有同源基因的概率(CI+CT+CO=1),I、T、O分別表示在CI、CT、CO條件下,被檢驗人之間有相同基因型的概率。根據孟德爾遺傳定律,堂表兄弟姐妹CO=3/4,CT=1/4,CI=0,則R1=(3/4)O+(1/4)T(2)。根據此公式可以計算出堂表兄弟姐妹各種基因型下的R1值,通過計算似然率(R1/R0)得出FCI,最后根據FCI計算CFCI。

  1.4統計學分析

  用SPSS20統計學軟件對124對堂表兄弟姐妹和186對無親緣關系個體的CFCI進行統計分析,分別檢驗兩組數據的正態性,并進行非參數檢驗;同時用Fisher判別分析法,依據各基因座的FCI建立堂表對-無關個體對的判別方程。

  相關期刊推薦:《中國法醫學雜志》主辦單位:中國法醫學會;公安部物證鑒定中心。主要發表法醫病理學、法醫物證學、法醫毒物分析、法醫臨床學、法醫精神病學等及其相關學科的新進展、新觀點、新技術和新成就。主要欄目設置有:論著及其摘要,技術交流,案例分析及報道,述評,綜述,講座,法醫學教育,國外法醫學。

  2結果

  2.1IBD法的計算結果

  124個堂表對18個常STR基因座的CFCI最大值為153.692,最小值為0.104,平均為11.864±21.678;186個無關個體對的CFCI最大值為6.945,最小值為0.022,平均為0.605±0.988。經正態分布檢驗,CFCI在2組人群中的頻率分布呈偏正態分布(圖1a、1b)。采用非參數檢驗對堂表對和無關個體的CFCI進行比較,結果顯示平均堂表關系指數在兩組人群中的分布差異有統計學意義(Z=-13.003,P<0.001)。

  2.2堂表對和無關個體對的分布

  從表1可以看出,只有具有堂表關系者的CFCI/(CFCI+1)≥0.9,無關個體對沒有CFCI/(CFCI+1)≥0.9的情況出現;有24個堂表對(占所有堂表對的19.355%)和4個無關個體對(占所有無關個體對的2.151%)的CFCI/(CFCI+1))在0.8≤CFCI/(CFCI+1)<0.9之間;在0.7≤CFCI/(CFCI+1)<0.8和0.6≤CFCI/(CFCI+1)<0.7之間時,各有27個和14個堂表對(占所有堂表對的21.774%和11.290%)及4個和7個無關個體對(占所有無關個體對的2.151%和3.763%)出現;而當CFCI/(CFCI+1)<0.6時,則無關個體對占所有無關個體對的絕對多數(171個,占91.935%),堂表關系對只有21個(占所有堂表對的16.935%)。CFCI/(CFCI+1)≥0.6時,310個個體對中,36個被誤判,274個被正確判斷出,綜合判別準確率為88.387%。

  2.3建立判別方程

  應用多元判別分析和多元逐步判別分析方法,依據各常STR基因座FCI計算結果,對堂表對-無關個體對進行判別分析。

  堂表對-無關個體對的多元判別分析:設Y1:堂表對;Y2:無關個體對,X1:D3S1358,X2:D13S317,X3:D7S820,X4:D16S539,X5:PentaE,X6:TPOX,X7:TH01,X8:D2S1338,X9:CSF1PO,X10:D19S433,X11:vWA,X12:D21S11,X13:D18S51,X14:D6S1043,X15:D8S1179,X16:D5S818,X17:D12S391,X18:FGA。

  Y1=26.605X1+8.871X2+7.146X3+20.422X4+2.522X5+34.818X6+26.892X7+18.807X8+6.705X9+11.240X10+6.855X11+1.313X12+1.550X13+9.739X14+4.811X15+16.958X16+2.943X17+14.071X18-126.668;

  Y2=21.663X1+11.079X2+8.166X3+16.639X4+0.326X5+30.501X6+23.157X7+15.217X8+5.481X9+8.906X10+6.642X11+1.497X12+0.844X13+7.438X14+5.357X15+15.171X16+2.403X17+10.360X18-92.910。

  當Y1>Y2時判斷為兩者具有堂表親緣關系,當Y1個體。結果在124個堂表對中有109個Y1>Y2,占所有堂表對的87.903%,有15個Y1Y2,占所有無關個體對的4.839%,有177個Y1Y2時判斷為兩者具有堂表親緣關系,當Y1Y2,占所有堂表對的87.097%,有16個Y1Y2,占所有無關個體對的4.839%。——論文作者:李梅,李詩瑩,程柳,孫灝琳,張倍倍,林子清

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